Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Faf1P54731 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms