Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PctpP53808 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PctpP53808 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms