Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fdft1P53798 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms