Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cux1P53564 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms