Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp1P52624 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upp1P52624 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms