Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LumP51885 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LumP51885 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LumP51885 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LumP51885 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms