Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfP51642 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfP51642 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CntfP51642 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CntfP51642 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CntfP51642 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms