Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RoraP51448 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RoraP51448 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RoraP51448 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RoraP51448 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms