Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms