Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl5P50228 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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