Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp3P49194 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms