Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms