Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms