Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms