Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd9P40240 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd9P40240 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms