Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms