Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms