Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms