Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HexaP29416 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HexaP29416 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HexaP29416 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HexaP29416 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HexaP29416 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HexaP29416 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HexaP29416 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms