Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxraP28700 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxraP28700 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxraP28700 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxraP28700 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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