Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms