Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CebpbP28033 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms