Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg3P27681 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms