Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms