Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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