Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f1P21952 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms