Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a1P19437 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms