Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P18533 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18533 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18533 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18533 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms