Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms