Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn1P12960 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms