Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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