Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SparcP07214 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SparcP07214 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SparcP07214 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms