Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf1P07141 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms