Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TnfP06804 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnfP06804 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnfP06804 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnfP06804 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnfP06804 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms