Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01851 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01851 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01851 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01851 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01851 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01851 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01851 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01851 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms