Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01678 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01678 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01678 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01678 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms