Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01629 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01629 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01629 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01629 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01629 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms