Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms