Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShdO88834 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShdO88834 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShdO88834 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ShdO88834 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ShdO88834 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ShdO88834 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ShdO88834 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ShdO88834 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ShdO88834 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ShdO88834 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms