Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms