Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms