Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SfnO70456 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SfnO70456 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SfnO70456 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SfnO70456 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms