Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtssO70370 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtssO70370 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtssO70370 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms