Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms