Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms