Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp10aO54827 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp10aO54827 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms