Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms