Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-ObO35424 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-ObO35424 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-ObO35424 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-ObO35424 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-ObO35424 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms