Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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