Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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